سقنقور الرمل المنقط، تشبه أفراده أفراد الأنواع الأخرى من نفس الجنس من حيث الصفات العامة، إلا أنه توجد هناك مجموعة من الصفات المميزة له. فالرأس وتدي الشكل، صغير نسبياً من حيث الطول والعرض. فمن حيث الطول نجد أن الرأس في الأفراد البالغة يمثل في المتوسط حوالي (20%) من طول المسافة الممتدة من بداية البوز وحتى فتحة المجمع. أما من حيث العرض فنجده مساوياً أو يقل بعض الشيء عن عرض منطقة الرقبة أو منطقة اتصال الرقبة بالطرفين الأماميين. كما أن عرض الرأس يقل عن طوله بمقدار (40%) تقريباً. ينتهي الرأس من الأمام بالبوز، الذي يظهر أكثر طولاً عند النظر إليه من الناحية البطنية منه من الناحية الظهرية، ومن الناحية الأمامية يكون أقل عرضاً ولكنه أكثر استدارة ويساعده ذلك في الغوص سريعاً في الرمال.
تمتاز الحرشفة البوزية أن لها اتصال عريض مع الحرشفة الأنف-جبهية. ويرتفع الرأس تدريجياً وبصورة نسبية بدءاً من مقدمته حتى مؤخرته. عضوا الإبصار يمثلهما حدقتان بيضاويتا الشكل وهما أقرب لفتحتي الأذن منهما إلى البوز. وفي كل عين قرنية صغيرة نسبياً وبؤبؤ مستدير. فتحتا الأذن الخارجية صغيرتان جداً ولهما وضع مائل إلا أنه يمكن رؤيتهما بوضوح، وتقع كل فتحة تحت الخط الناتج من انغلاق الشفتين العلوية والسفلية من الناحية الخلفية. وتغطي كل فتحة عادة بحرشفتين كبيرتين نسبياً، حافتهما الأمامية ملساء والخلفية مسننة، والجانب الأخير (المسنن) يغطي الفتحة مباشرة.
فتحتا لأنف صغيرتا الحجم، جيدتا التكوين وتتخذ كل فتحة الشكل البيضاوي وأحياناً الشكل الهلالي وتقعان على جانبي مقدمة البوز. العنق غليظ ويتصل بالرأس بصورة لا يمكن معها تمييزه عن مؤخرة الرأس. الجذع مقوس في المقطع العرضي من الناحية الظهرية ومسطح من الناحية البطنية، وقطره يكاد يكون متجانس من مقدمته حتى مؤخرته. الأطراف صغيرة وضعيفة وينتهي كل طرف بخمسة أصابع قصيرة مسطحة، الأصبع الرابع في الأطراف الخلفية الأطول بين بقية الأصابع. الذيل متوسط الطول تقريباً حيث يقل طوله عن طول الجسم من بداية البوز وحتى فتحة المجمع، وبالرغم من أن قاعدته عريضة جداً وتماثل تقريباً عرض منطقة اتصاله بالطرفين الخلفيين فإنه ينضغط من الجانبين ويستدق بشدة ناحية الخلف ويأخذ بذلك الشكل المخروطي.
حراشف الجسم لامعة جداً، ملساء متراكبة ذات عوارض، لها شكل سداسي، وتنتظم في صفوف طولية. حراشف الناحية الظهرية في الأفراد الصغيرة أو البالغة عادةً ما تكون ملساء ولامعة. حراشف الخط المنصف من الناحية الظهرية كبيرة وعريضة لا تلبث أن تصغر في الحجم تدريجياً نحو الجانبين قبل أن تعود وتكبر من الناحية البطنية وتصبح مساوية تماماً للحراشف الموجودة على الخط المنصف البطني. يبلغ متوسط عدد حراشف الجسم حول وسط الحيوان ما بين (27-30) حرشفة. اللون السائد للحيوان في الطبيعة هو اللون البني الفاتح أو اللون الأصفر الفاقع نسبياً المائل إلى لون الرمال الناعمة التي تمثل البيئة الطبيعية للحيوان.
جوانب الجسم والأطراف يميل اللون فيها إلى الأصفر الباهت بينما يميل لون الناحية البطنية من الجسم إلى اللون الأبيض أو الكريمي. الحيوانات البالغة تمتاز بوجود عدد قليل ومحدد من بقع أو أشرطة رأسية تنتشر على الجانبين تتلون باللون البني الداكن أو اللون البرتقالي المحمر. تبدأ هذه الأشرطة أو البقع من مقدمة الطرفين الأماميين وتمتد حتى بداية الطرفين الخلفيين، ولم تلحظ أي بقع خلف الأطراف الخلفية أو على جانبي الذيل.